مولانا فضل‌الرحمن یکی از چهره‌هایی است که در سال‌های اخیر بارها سیاست امنیتی دولت پاکستان را زیر سؤال برده است. او به جای تمرکز بر متهم کردن همسایگان، بر ضرورت بازنگری در سیاست‌های داخلی و گفت‌وگو با گروه‌های مختلف تأکید کرده است.

مولانا فضل‌الرحمان، رهبر جمعیت علمای اسلام پاکستان، در اظهاراتی کم‌سابقه، ارتش این کشور را به کشتار غیرنظامیان در مناطق قبایلی و نوار مرزی متهم کرده است.